MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1 chromosome

Total Repeats: 5339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018655	AAG	2	6	2442	2447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018655	GAT	2	6	3086	3091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018655	T	6	6	7862	7867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018655	TAAAT	2	10	7875	7884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018655	ATT	2	6	7902	7907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018655	AATT	2	8	7921	7928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018655	T	7	7	7933	7939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018655	A	6	6	7940	7945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018655	TACT	2	8	7973	7980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018655	AAC	2	6	7990	7995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018655	CT	3	6	8005	8010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018655	T	6	6	8031	8036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018655	T	7	7	8055	8061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018655	A	6	6	8076	8081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018655	ACTCA	2	10	20144	20153	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_018655	ACTAA	2	10	24615	24624	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018655	TGTT	2	8	24639	24646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018655	AAT	2	6	24863	24868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018655	CCA	2	6	24935	24940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018655	TTA	2	6	24943	24948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018655	TTC	2	6	24983	24988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018655	ATT	2	6	24994	24999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018655	AAT	2	6	25008	25013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018655	T	8	8	25040	25047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018655	GTA	2	6	27151	27156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018655	TAA	2	6	27646	27651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018655	A	7	7	27667	27673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018655	TCT	2	6	30772	30777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018655	TTG	2	6	30785	30790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018655	CATTT	2	10	31343	31352	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018655	CAT	2	6	31353	31358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018655	CTAA	2	8	31359	31366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018655	TAAA	2	8	31398	31405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018655	A	7	7	31403	31409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018655	TTG	2	6	35212	35217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018655	TAA	2	6	35221	35226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018655	CATT	2	8	36328	36335	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018655	TAAAA	2	10	36382	36391	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018655	CCT	2	6	38729	38734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_018655	A	6	6	38738	38743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018655	T	6	6	38759	38764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018655	CTT	2	6	38765	38770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018655	ATT	2	6	39475	39480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018655	ACTATA	2	12	39486	39497	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018655	TAA	2	6	43699	43704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018655	ATC	2	6	43754	43759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018655	ATC	2	6	43768	43773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018655	T	6	6	43783	43788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018655	CAA	2	6	43827	43832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018655	ATG	2	6	43838	43843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018655	AAC	2	6	43845	43850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018655	TAG	2	6	43864	43869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018655	GAT	2	6	43870	43875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018655	GAT	2	6	43945	43950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018655	TTAC	2	8	44029	44036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018655	TCC	2	6	44046	44051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_018655	AGT	2	6	44124	44129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018655	ACA	2	6	44133	44138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018655	GAT	2	6	44190	44195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018655	A	6	6	44221	44226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018655	AAC	2	6	44234	44239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018655	AGAA	2	8	44269	44276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018655	A	8	8	44275	44282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018655	GAA	2	6	44306	44311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018655	TAT	2	6	44351	44356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018655	ATT	2	6	44411	44416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018655	A	6	6	44418	44423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018655	T	6	6	44447	44452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018655	ATT	2	6	44503	44508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018655	A	6	6	44550	44555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018655	GAAAA	2	10	44564	44573	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018655	A	6	6	44570	44575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018655	A	6	6	44597	44602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018655	AAAT	2	8	44644	44651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018655	ATA	3	9	44731	44739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018655	AGA	2	6	44747	44752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018655	GAA	2	6	44778	44783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018655	GA	3	6	44801	44806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018655	AAT	2	6	44817	44822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018655	T	7	7	46372	46378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018655	GCT	2	6	46455	46460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018655	AGTT	2	8	47570	47577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018655	CTT	2	6	53047	53052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018655	TGT	2	6	53077	53082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018655	TAA	2	6	53093	53098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018655	TCT	2	6	53178	53183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018655	TCT	2	6	55127	55132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018655	T	6	6	57875	57880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018655	TTA	2	6	57892	57897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018655	CCTA	2	8	61629	61636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018655	AAT	2	6	62597	62602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018655	T	7	7	62602	62608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018655	TAA	2	6	63811	63816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018655	T	7	7	63841	63847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018655	TCC	2	6	64217	64222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_018655	CAT	2	6	64294	64299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018655	T	6	6	64315	64320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018655	TCA	2	6	64323	64328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018655	A	6	6	64348	64353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018655	TCA	2	6	64395	64400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018655	T	6	6	64415	64420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018655	T	6	6	64423	64428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018655	AAG	2	6	64435	64440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018655	TGA	2	6	64459	64464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018655	TCT	2	6	64535	64540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018655	ACC	2	6	64562	64567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_018655	T	6	6	64578	64583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018655	TCTTT	2	10	64618	64627	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018655	ATCTC	2	10	64652	64661	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_018655	TTG	2	6	64687	64692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018655	TCC	2	6	64741	64746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_018655	CTA	2	6	64827	64832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018655	GTT	2	6	64849	64854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018655	T	7	7	64871	64877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018655	T	6	6	64891	64896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018655	CAT	2	6	64914	64919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018655	AAAT	2	8	64929	64936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018655	TCC	2	6	64987	64992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_018655	ATCT	2	8	65001	65008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018655	TCA	2	6	65015	65020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018655	T	6	6	65028	65033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018655	TC	4	8	65062	65069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018655	ATT	2	6	65147	65152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018655	ATC	2	6	65170	65175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018655	TCT	2	6	65180	65185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018655	AAATT	2	10	65196	65205	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018655	ATC	2	6	65206	65211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018655	TGT	2	6	65229	65234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018655	TGAA	2	8	65678	65685	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018655	TTGC	2	8	65730	65737	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018655	T	7	7	65787	65793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018655	AAT	2	6	65897	65902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018655	CTT	2	6	67034	67039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018655	GGT	2	6	67079	67084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018655	ATG	3	9	67105	67113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018655	GCCT	2	8	67131	67138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018655	GAT	2	6	67779	67784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018655	AT	3	6	67783	67788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018655	TA	3	6	69114	69119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018655	AATC	2	8	69168	69175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018655	A	6	6	69179	69184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018655	A	6	6	69191	69196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018655	CTA	2	6	69198	69203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018655	TAAT	2	8	70829	70836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018655	AAT	2	6	71357	71362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018655	T	6	6	72391	72396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018655	ATGA	2	8	74961	74968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018655	ATTC	2	8	74970	74977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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293	NC_018655	A	7	7	109541	109547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_018655	TAT	2	6	167188	167193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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